Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 AC068985.1-201ENST00000463297 703 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 AC068205.1-201ENST00000526615 689 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSEN1P49768 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.3 ms