Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTPAP49638 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTPAP49638 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTPAP49638 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTPAP49638 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTPAP49638 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTPAP49638 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTPAP49638 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTPAP49638 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTPAP49638 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTPAP49638 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTPAP49638 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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