Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCC3P46736 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms