Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PPARGP37231 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPARGP37231 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PPARGP37231 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PPARGP37231 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPARGP37231 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPARGP37231 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms