Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms