Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXA7P31268 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms