Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms