Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP1P29466 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP1P29466 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP1P29466 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP1P29466 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP1P29466 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP1P29466 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP1P29466 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP1P29466 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP1P29466 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP1P29466 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP1P29466 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP1P29466 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP1P29466 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP1P29466 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP1P29466 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP1P29466 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP1P29466 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP1P29466 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP1P29466 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP1P29466 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP1P29466 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms