Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms