Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NR4A1P22736 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms