Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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CXCL3P19876 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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CXCL3P19876 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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CXCL3P19876 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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CXCL3P19876 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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CXCL3P19876 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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