Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 LINC02270-202ENST00000515691 541 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms