Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GFAPP14136 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFAPP14136 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFAPP14136 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFAPP14136 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFAPP14136 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFAPP14136 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
GFAPP14136 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFAPP14136 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFAPP14136 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFAPP14136 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFAPP14136 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFAPP14136 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFAPP14136 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GFAPP14136 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GFAPP14136 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFAPP14136 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFAPP14136 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFAPP14136 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFAPP14136 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFAPP14136 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFAPP14136 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFAPP14136 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFAPP14136 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFAPP14136 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms