Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HOXD8P13378 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms