Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI2P10070 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI2P10070 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI2P10070 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI2P10070 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI2P10070 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI2P10070 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI2P10070 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI2P10070 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI2P10070 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI2P10070 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI2P10070 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI2P10070 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI2P10070 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI2P10070 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI2P10070 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI2P10070 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI2P10070 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI2P10070 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI2P10070 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI2P10070 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI2P10070 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI2P10070 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI2P10070 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI2P10070 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI2P10070 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI2P10070 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI2P10070 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI2P10070 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI2P10070 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI2P10070 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI2P10070 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI2P10070 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI2P10070 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI2P10070 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI2P10070 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI2P10070 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI2P10070 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI2P10070 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI2P10070 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI2P10070 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI2P10070 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI2P10070 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI2P10070 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI2P10070 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI2P10070 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI2P10070 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI2P10070 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI2P10070 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI2P10070 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI2P10070 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI2P10070 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI2P10070 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI2P10070 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI2P10070 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI2P10070 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI2P10070 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI2P10070 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI2P10070 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI2P10070 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI2P10070 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI2P10070 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI2P10070 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI2P10070 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI2P10070 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI2P10070 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI2P10070 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI2P10070 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI2P10070 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI2P10070 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI2P10070 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI2P10070 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI2P10070 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI2P10070 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI2P10070 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI2P10070 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI2P10070 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI2P10070 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI2P10070 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GLI2P10070 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GLI2P10070 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GLI2P10070 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GLI2P10070 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GLI2P10070 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GLI2P10070 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GLI2P10070 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GLI2P10070 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
GLI2P10070 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GLI2P10070 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
GLI2P10070 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GLI2P10070 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GLI2P10070 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
GLI2P10070 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GLI2P10070 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
GLI2P10070 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GLI2P10070 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GLI2P10070 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI2P10070 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI2P10070 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI2P10070 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms