Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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FAM58BPP0C7Q3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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FAM58BPP0C7Q3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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FAM58BPP0C7Q3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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FAM58BPP0C7Q3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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FAM58BPP0C7Q3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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FAM58BPP0C7Q3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM58BPP0C7Q3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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FAM58BPP0C7Q3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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FAM58BPP0C7Q3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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FAM58BPP0C7Q3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM58BPP0C7Q3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM58BPP0C7Q3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM58BPP0C7Q3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM58BPP0C7Q3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM58BPP0C7Q3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM58BPP0C7Q3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM58BPP0C7Q3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM58BPP0C7Q3 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM58BPP0C7Q3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM58BPP0C7Q3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM58BPP0C7Q3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM58BPP0C7Q3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM58BPP0C7Q3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM58BPP0C7Q3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM58BPP0C7Q3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM58BPP0C7Q3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM58BPP0C7Q3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM58BPP0C7Q3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM58BPP0C7Q3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM58BPP0C7Q3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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