Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC24DO94855 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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