Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F6O75461 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F6O75461 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F6O75461 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms