Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPHP4O75161 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPHP4O75161 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPHP4O75161 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPHP4O75161 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPHP4O75161 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPHP4O75161 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPHP4O75161 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPHP4O75161 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPHP4O75161 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NPHP4O75161 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms