Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGRPO00253 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AGRPO00253 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AGRPO00253 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRPO00253 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGRPO00253 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGRPO00253 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGRPO00253 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGRPO00253 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGRPO00253 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGRPO00253 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGRPO00253 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGRPO00253 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGRPO00253 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms