Protein–RNA interactions for Protein: C9JFL3

PHGR1, Proline, histidine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGR1C9JFL3 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PHGR1C9JFL3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms