Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
B4DEV8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
B4DEV8 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
B4DEV8 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
B4DEV8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
B4DEV8 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
B4DEV8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
B4DEV8 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
B4DEV8 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
B4DEV8 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
B4DEV8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
B4DEV8 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
B4DEV8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
B4DEV8 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
B4DEV8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
B4DEV8 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
B4DEV8 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
B4DEV8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
B4DEV8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
B4DEV8 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
B4DEV8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
B4DEV8 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
B4DEV8 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
B4DEV8 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
B4DEV8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
B4DEV8 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
B4DEV8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
B4DEV8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
B4DEV8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
B4DEV8 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
B4DEV8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
B4DEV8 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
B4DEV8 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
B4DEV8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
B4DEV8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
B4DEV8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
B4DEV8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
B4DEV8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
B4DEV8 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
B4DEV8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
B4DEV8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
B4DEV8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
B4DEV8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
B4DEV8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
B4DEV8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
B4DEV8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
B4DEV8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
B4DEV8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
B4DEV8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
B4DEV8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
B4DEV8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
B4DEV8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms