Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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C4orf47A7E2U8 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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C4orf47A7E2U8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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C4orf47A7E2U8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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C4orf47A7E2U8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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