Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAMEF25A6NGN4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms