Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SNX13Q9Y5W8 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SNX13Q9Y5W8 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SNX13Q9Y5W8 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SNX13Q9Y5W8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SNX13Q9Y5W8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SNX13Q9Y5W8 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SNX13Q9Y5W8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SNX13Q9Y5W8 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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