Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLXND1Q9Y4D7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms