Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM2AQ9Y2K7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms