Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RCE1Q9Y256 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RCE1Q9Y256 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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