Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF346Q9UL40 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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