Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms