Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms