Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC52A3Q9NQ40 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms