Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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NRIP3Q9NQ35 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NRIP3Q9NQ35 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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