Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PARD6AQ9NPB6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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