Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSU72Q9NP77 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms