Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP50

FAM60A, Protein FAM60A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM60AQ9NP50 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM60AQ9NP50 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms