Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.06■□□□□ 0
POLR2J2Q9GZM3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms