Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SMIM3Q9BZL3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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