Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SNHG12Q9BXW3 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms