Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VAMP8Q9BV40 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms