Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIK3R4Q99570 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms