Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms