Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGAP1Q96PV0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms