Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms