Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
LINC00208Q96KT6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms