Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms