Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNF34Q969K3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF34Q969K3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms