Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHMTQ93088 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms