Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVL7

ANKRD49, Ankyrin repeat domain-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD49Q8WVL7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD49Q8WVL7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms