Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFD5

ARID1B, AT-rich interactive domain-containing protein 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1BQ8NFD5 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARID1BQ8NFD5 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARID1BQ8NFD5 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms